Dalam pemilu 1999 juga terselenggara pemilu untuk pemilihan Presiden dan Wakil Presiden.
Abdurrahman Wahid dan Megawati Soekarnoputri dipilih dan ditetapkan oleh MPR RI sebagai Presiden dan Wakil Presiden RI.
Kemudian, pasangan Abdurrahman Wahid - Megawati Soekarnoputri digantikan oleh pasangan Megawati Soekarnoputri - Hamzah Haz berdasarkan Sidang Istimewa MPR RI, 23 Juli 2001, melalui Ketetapan MPR RI No. II/MPR/2001.
Sementara pemilu tahun 2004 adalah pemilihan umum pertama pasca perubahan amandemen UUD 1945.
Perubahan yang terjadi adalah Presiden dipilih secara langsung, dibentuknya Dewan Perwakilan Daerah (DPD), adanya Penyelenggara Pemilu yang bersifat nasional, tetap dan mandiri (Komisi Pemilihan Umum).
Pada pemilu anggota DPR, DPD dan DPRD tahun 2004 ini diikuti oleh 24 partai politik dan dilakukan pada 5 April 2004.
Sementara untuk pemilihan umum Presiden dan Wakil Presiden 2004 dilaksanakan pada 5 Juli 2004 (putaran I) dan 20 September 2004 (putaran II).
Ada 5 pasangan calon Presiden dan Wakil Presiden yang ikut dalam pemilu 2004 ini, girls.
Untuk hasil, Susilo Bambang Yudhoyono dan Jusuf Kalla terpilih sebagai Presiden dan Wakil Presiden RI periode 2004 - 2009.
Baca Juga: Spesifikasi Kotak Suara Pemilu 2024, Perlengkapan Pemungutan Suara Menurut Peraturan KPU