Beasiswa Mawapres sebagai bentuk apresiasi Unika Atma Jaya kepada para finalis kompetisi tahunan Mawapres berdasar peringkat akhir pemilihan Mahasiswa Berprestasi. Para finalis tersebut akan diberi keringanan biaya kuliah berupa potongan uang kuliah pokok (BKP) dan uang kuliah SKS (BKS) atau kuliah paket selain mendapatkan hadiah. Besarnya keringanan biaya kuliah tersebut diatur dalam peraturan (SK) tersendiri.